芜湖市第三人民医院(市传染病医院)创建于1973年，是皖南地区最早建立的传染病专科医院。主要承担一市三县和皖南地区的传染病防治任务。医院位于城市东南部，袁泽桥东侧，距中心商业区5公里。医院占地面积30亩，建筑面积14000平方米，床位200张。是省卫生厅批准的政府举办的非营利性公共卫生事业单位，是全市sars、禽流感、性病、艾滋病、甲型h1n1流感及手足口病定点医疗机构。
芜湖市和宣城市职工、居民医保(新农合)定点医疗机构，2010年，被授予园林单位、市诚信医院、文明窗口单位、省卫生先进单位。2011年，被授予芜湖市第十四届市级文明单位、无烟医疗卫生单位和芜湖优质服务岗，医院设有肝病科、皮肤性病科、肝胆外科、放射介入科、血液净化中心、检验科、药品配送中心等临床医技科室。其中肝病科是医院的重点专科，专治各型肝炎、肝硬化、肝腹水、肝癌等肝病。首家引进人工肝支持系统，提高了重症肝炎的抢救成功率。运用介入化疗各期肝癌，为肿瘤患者提供了高效、价廉的治疗方法。其中腹水浓缩回输技术治疗肝硬化腹水和血浆置换与自血光量子联合治疗重型肝炎等科研项目获省、市科技进步奖。
2010年5月开业的市三院东门街道社区卫生服务中心建筑面积3000平方米，设老年病房、残疾人康复中心，提供医疗、预防、保健、康复、计划生育指导、健康教育“六位一体”服务，为附近社区及开发建设中的镜湖新城、绿地镜湖新世纪等大型社区十余万居民服务。经过近三十年的建设和发展，市三院已成为专业从事传染病检测、监控、科研、防治为一体的专科特色医院，北京地坛医院皖南合作医院。